El otro día, compartiendo un café con un profesor (un mentor, un amigo, mejor dicho), me preguntó si conocía alguna herramienta para hacer buenos pedigrís genéticos para utilizarla en clase. Y me picó la curiosidad.
Recordaba haber visto hace ya algún tiempo una que tenía muy buena pinta, pero no recordaba cuál era, así que tocaba hacer la búsqueda de nuevo.
La buena noticia es que parece que hay unas cuantas herramientas de pedigrís. La "mala noticia" es que no tengo tiempo de probarlas todas.
Aquí os las dejo, si probáis alguna de ellas, me encantaría que compartieseis vuestra experiencia:
Recordaba haber visto hace ya algún tiempo una que tenía muy buena pinta, pero no recordaba cuál era, así que tocaba hacer la búsqueda de nuevo.
La buena noticia es que parece que hay unas cuantas herramientas de pedigrís. La "mala noticia" es que no tengo tiempo de probarlas todas.
Aquí os las dejo, si probáis alguna de ellas, me encantaría que compartieseis vuestra experiencia:
Genial. PedigreeDraw
Este tiene buena pinta. Una herramienta online gratuita con muchas posibilidades. Los resultados son prometedores. |
HaploPainter
Otro programa con muy buena pinta. Que permite, además de hacer pedigrís sencillos, añadirles haplotipos más complejos. En la sección de descargas incluyen también la documentación necesaria para utilizarlo. |
Invitae Family History Tool
Una app para iOS de construcción de pedigrís con los mínimos requeridos para poder estar en la App Store... y gratuita. Tenía que estar en esta selección. |
Madeline Pedigree Drawing Engine
Herramienta de la Universidad de Michigan. Descargable para Linux, Mac y Windows. Se atreven a comparar su programa con otras herramientas disponibles. En OpenHelix ofrecen tutoriales de uso de Madeline. |
Pedigree.Varphi.
Ofrecen la descarga de una suite completa, aunque avisan que para hacer pedigrís realmente complejos es mejor estar familiarizado con TeX y PSTricks. De todas maneras, también ofrecen una herramienta online gratuita para hacer pedigrís más sencillos. |
Panogram (Github)
"Una herramienta de pedigrís online que se puede enlazar con los datos de los pacientes". En este enlace accdemos al readme, con la información de cómo instalarlo. |
Online Pedigree Tool (de Progeny)
Herramienta Freemium. En la versión gratuita no puedes grabarte el pedigrí en un archivo ni, claro, modificarlo luego. |
CeGaT pedigree Chart Designer
El Center for Genomics and Transcriptomics ofrece esta herramienta gratuita que requiere el Java Webstart para utilizarla. Siempre va bien disponer de una guía de uso. |
PediDraw
Herramienta del China Genetic Counseling Network completamente online: vas introduciendo tus datos y te devuelve un pedigrí completo. Publicaron un artículo científico cuando pusieron en marcha la herramienta, |
Fuentes con enlaces a otras herramientas
- The OpenHelix Blog
- OMIC tools
- GitHub
- Section on Statistical Genetics del School of Public Health de la Universidad de Alabama en Birmingham (UAB)